唐王政权在形势一片大好的时候突然出现内乱，虽然这个情况被朱聿键在内部实现了和平解决，但是这无疑是耽误了很宝贵的推进时间，此前荷兰东印度公司打算乘胜追击把双方战线推进到江浙，然而现在看来这个计划已经不太可能实现了，当然荷兰东印度公司通过唐王政权扩大贸易深入大明的计划实现的非常的成功，这让荷兰人赚取了巨大的商业利益。而随着资金的增加荷兰决定主动出击，当然此时唐王政权的领地已经被各个藩镇势力割据，这就让荷兰军队全面进入大明本土作战很困难，在这种情况下荷属南海总督范加尔中将决定要去入侵福尔摩沙，他认为如果荷兰能够拿下福尔摩沙，那就相当于他们控制了整个东海的制海权，到时候他们不但可以切断新卡斯蒂利亚和菲律宾的联系，荷兰舰队还能直接威胁整个江浙沿海地区。
此时荷属南海的荷兰人已经通过双边贸易和销售军火积攒了大量财富，在这种情况下范加尔中将很快就集结一支由欧洲士兵，南洋土著和大明流民组成的远征军并且还打造了远洋舰队，在这种情况下范加尔中将对远征福尔摩沙非常有信心，除此之外他也眼红于黄琦的军队能接连击败西班牙联军，于是范加尔中将也想趁机建功立业谋求军功。于是范加尔中将就信心十足的率领准备完毕的荷兰军队前去远征福尔摩沙，很快荷兰军队就抵达了福尔摩沙南部的垦丁地区，而此时西班牙人在福尔摩沙的力量则主要还在北部，西班牙军队在南部基本上连岗哨都没有，于是范加尔中将轻松的在垦丁登陆，此时福尔摩沙南部连汉人的移民都基本上没有，全是藏在深山老林里的原住民族群，不过对于范加尔中将来说这些人完全不重要，他立刻在垦丁建立据点和码头用于屯驻军队和舰队。
除此之外范加尔中将还大力联络原住民，他们这些新教势力对传播宗教没有兴趣，荷兰想要的是这些原住民的市场和合作，所以范加尔中将积极的笼络原住民，对于企图反抗的原住民则重拳出击，他希望用恩威并施的方法让原住民臣服于自己，很快福尔摩沙南部的大量原住民纷纷选择归顺荷兰，他们给荷兰带来了很多熟悉地形的士兵。而荷兰人的动静自然没有瞒过西班牙人，由于新卡斯蒂利亚给西班牙带来的巨大利益，西班牙对福尔摩沙地区的重视也越来越大，很快西班牙就任命加索尔少将担任福尔摩沙总督，并且还让他负责在福尔摩沙北部建造仓库和港口，以此就可以储存货物和战船，福尔摩沙被视为菲律宾和新卡斯蒂利亚之间的中转站，除此之外加索尔少将麾下的的兵力也随着收入提高和福尔摩沙重要性提高而大幅度上升。
福尔摩沙总督加索尔少将在得知了荷兰人的东西后非常的震惊，他非常清楚如果让荷兰军队拿下福尔摩沙的后果，于是他赶紧派人向菲律宾和新卡斯蒂利亚方向求援，除此之外他还需要做出部署去抵挡荷兰军队北上，于是他让自己的弟弟小加索尔上校提前率领殖民军精锐出发前往日月潭去防守。小加索尔上校得到命令后立刻集结殖民军和忠于西班牙的原住民武装前往日月潭，西班牙人此前对于皈依天主教的原住民非常的友好，所以信仰天主教的原住民在这场战争中基本上都倒向了西班牙人，所以等到范加尔中将的荷兰殖民军抵达日月潭时，小加索尔上校麾下的西班牙联军已经准备就绪了，他们依托地形修建了大量的堡垒和工事，西班牙人甚至还在湖里部署了炮艇控制日月潭。
范加尔中将见状后顿时非常的震怒，他非常清楚西班牙军队控制日月潭就能以此为桥头堡去威胁福尔摩沙的西部和东部，所以他如果想要拿下福尔摩沙就必须要拿下日月潭，于是范加尔中将就立刻率领荷兰殖民军和原住民武装前去围攻日月潭。然而虽然小加索尔上校的工事都是他们仓促修建的，但是原住民临时组织起来的武装都很缺乏火力，荷兰殖民军为了加快速度轻装上阵，这导致荷兰联军这边缺乏攻坚用的火炮，加上加索尔上校所部占据有利地形去坚守，这导致荷兰军队无法取得突破。范加尔中将见军队打不动顿时大怒，于是他立刻调来范巴斯滕上校和博格坎普上校指挥的两路军队，他集结了他手上的全部主力军去围攻日月潭，并且还下令把重型火炮从垦丁运到前线，但是小加索尔上校依旧凭借着地形优势展开坚守，荷兰殖民军虽然人多但是在森林里无法发挥。
而很快加索尔少将率领上万西班牙殖民军抵达日月潭，范加尔中将见状只好帅不从日月潭解围，然后他转而集中荷兰军队跟西班牙军队在日月潭周边进行拉锯战，至此范加尔中将之前想要迅速拿下福尔摩沙的计划以失败告终，而接下来荷兰军队和西班牙军队在福尔摩沙的中部展开了激烈的交战，但是谁都无法在短时间内去打破僵局。而这个旷日持久的战争也极大的改变了福尔摩沙，此前原住民在中部组建的大肚王国在战争中分崩离析，部众全部被西班牙和荷兰双方拐走去支持战争，而那些想要反抗殖民军的势力则纷纷被消灭，那些少数不想卷入战争的部族被迫撤入深山，而汉人移民也分为两个部分分别支持西班牙和荷兰参加战争，到了之后西班牙和荷兰还纷纷从大后方的菲律宾和婆罗洲征召当地人来福尔摩沙参战。
荷兰殖民军无法在福尔摩沙迅速取得进展，于是荷兰东印度公司就开始打算在海上去发动进攻，他们计划集结突击舰队并且联合郑芝龙所部水师突袭淡水，直接攻打福尔摩沙西班牙殖民军的后方，到时候福尔摩沙总督加索尔少将会首尾难顾，荷属南海总督范加尔中将再率领军队去进攻，肯定可以彻底击溃西班牙军队。然而郑芝龙对这个计划非常没兴趣，现在郑芝龙当上闽国公并且在闽南立足，所以他并不想为了东印度公司的利益去浪费战船，而他的这个看法在唐王政权内部也非常有代表性，唐王旗下的这些手握重兵的将领都想割据一方称王称霸，而那些想恢复旧山河的除了唐王朱聿键外，其实也就跟西班牙处于战争状态的荷兰东印度公司，之后荷兰东印度公司通过威逼利诱和软磨硬泡后才成功说服郑芝龙出兵帮助自己。
就这样荷兰和郑芝龙组成的联合舰队就打算强行通过台湾海峡突袭淡水，结果很快他们就遭遇了突然出现的西班牙舰队，虽然他们成功的击退了西班牙舰队，但是郑芝龙舰队总指挥总兵施琅则认为行踪已经暴露不如赶紧撤军，荷兰人对于这种想要保存实力的态度自然很不高兴，于是他们强令舰队继续前往淡水。结果果然不出所料他们遭遇了西班牙人派来的拦截舰队，不过出乎意料的是他们遭遇的是新卡斯蒂利亚的主力舰队，结果施琅见状立刻就建议逃跑，然后带着郑氏舰队头也不回地撤退，荷兰舰队见状也没有脸说早就提醒他们的施琅什么，于是他们也赶紧向广东方向撤退，至此荷兰方面处心积虑的出击淡水的计划就如此虎头蛇尾的结束了。
而荷兰海军的这次突袭给了西班牙人灵感，于是西班牙方面也打算用舰队进行突袭，他们直接在菲律宾集结了强力舰队，西班牙人打算绕过福尔摩沙直接打荷属南海，打到现在他们也发现荷属南海是荷兰军队前去出兵明国和福尔摩沙的中央基地，因此西班牙人打算直接用这支舰队摧毁荷属南海，如果这种事情发生荷兰军队将会元气大伤乃至迅速的崩溃。然而西班牙舰队在离开菲律宾后就接连的遭遇了大大小小的风暴，在这种情况下他们迅速暴露了行踪，荷属南海总督范加尔中将见状立刻下令调集舰队前去拦截，在这种情况下陷入困境的西班牙舰队由于风暴打击已经无力应战，所以西班牙人只能选择撤退回到菲律宾，就这样双方在南海寻求水上突破的努力全部失败。