准噶尔部首领巴图尔浑台吉立刻集结了本部准噶尔部的精锐骑兵跟尧勒巴斯汗在别失八里会和，然后巴图尔浑台吉就率领麾下的大军直扑吐鲁番，结果很快他就在天山中部遇到了明军总兵刘文秀，原来此前西域提督刘钰命令总兵杨承祖和刘文秀向四周扩大战果，杨承祖则奉命率部向南拿下高昌，刘文秀则按照刘钰的命令挺进天山周围展开活动。

结果刘文秀很快就遭遇了准噶尔部主力，刘文秀见对面骑兵气势汹汹就觉得来者不善善者不来，于是他立刻率领部队迅速控制了山区制高点，同时他派出骑兵向刘钰通报敌情，而巴图尔浑台吉见状就率领准噶尔骑兵包围刘文秀，然后他表示自己要保卫叶尔羌汗国，而刘文秀则表示自己绝不后退，于是双方谈判破裂后立刻开打。

双方一交手后刘文秀顿时惊讶的发现，对面的准噶尔军队竟然装备了大量火绳枪，这和他心目中野蛮落后的的蛮夷戎狄大相径庭，巴图尔浑台吉麾下的准噶尔骑兵用火绳枪对明军阵地展开了齐射，而刘文秀则指挥明军使用火绳枪和红衣大炮还击，就这样双方展开激烈的对射，准噶尔部从沙俄那边搞到很多新式武器，这是他们跟明军对抗的底气。

然而准噶尔部装备的新式武器虽然非常精良，但是刘文秀旗下的明军的新式武器也不比他们差，更何况刘文秀还及时的抢先占领了高地展开防御，这就让巴图尔浑台吉无法发挥他的骑兵和火器了，巴图尔浑台吉指挥准噶尔骑兵和叶尔羌军队轮番攻打明军阵地，结果他们全都被刘文秀麾下身经百战的农民军降兵给击退了。

而这个时候刘钰率领总兵李成栋和杨承祖等部明军赶到了战场，刘钰见状立刻就命令李成栋攻打尧勒巴斯汗的叶尔羌军队，杨承祖则奉命攻打巴图尔浑台吉，刘钰亲自率领去本部人马在后面接应，结果杨承祖很快跟侧翼的准噶尔部骑兵展开激烈的战斗，然而叶尔羌军队面对李成栋直接一触即溃，毕竟这支军队本来就是由民兵和教徒组成，他们基本上可以说是毫无战斗经验。

结果李成栋直接率领明军打垮了对面的叶尔羌军队，甚至尧勒巴斯汗都当场被李成栋直接砍死，于是很快叶尔羌军队被李成栋打得全线崩溃，结果这些叶尔羌败兵直接把后面的准噶尔军队冲散了，结果刘钰趁机率领主力明军展开了大举冲锋，杨承祖在侧翼也发动了攻势，刘文秀也来去主动进攻，最终阵型已乱的准噶尔军队被各路明军打得是全线崩溃，巴图尔浑台吉简直只能率领麾下准噶尔军队狼狈的逃回了别失八里。