第二天一早，五人便来到江口村。先找到萧里长，说明自己的来意。萧里长一听是茅山来的，便热情的迎他们进去，并向众说述起苦来：“这几日，我是操碎了心，镇里的大夫一听是瘟疫，便不肯前来看病了。原来相熟的几位郎中，也不敢来了。十里八村的人见了我，就像见了瘟神似的，躲得远远的。几位道长能来，真是福缘，真是老天保佑，江口村这下有救了。”

许胤宗道：“我等才疏学浅，定当竭尽所能，为乡亲们治好病。烦请萧里长带我们去看看情况。”

一圈看下来，几乎是家家见病人，户户备棺材，一片呻吟绝望之声，不绝于耳。经过大略一看，见病人寒热交攻，上吐下泄，便断定为疟疾。

许胤宗便进行了分工。甄谋马上去城里购买治疟的药材，李丁去江口村祠堂支锅烧水熬药，孙思邈则去采集附近能找到的青蒿等药材。他和甄权则挨家挨户，一个个确诊，并登记造册，统计好人数，及病者家里情况，分批做好医治工作，病情重的先治，轻的后治，无病的也要喝一两碗药汤预防。

统计结果是：现在发病的为三个村子，发病人数八百九十二人，发病者多为老人和儿童，最先发病的是江口村，接着是附近的沙口村和滩头村，三村总人口为三千二百二十一口。

第二日发病人数增加八十人，第三日增加三十三人，第四日发病人数不再增长。所选用方为葛仙翁《肘后备急方》，用青蒿煮药汤。

最终成功治愈一百八十一人，死亡八百二十人，治愈者不足十分之二。孙思邈等五人亦被感染，还好都治愈了。