在《经方应用十五案》中，石应轩通过多个案例阐述了辨证论治的具体应用。例如：

-头肿案：患者头皮肿胀，根据《内经》治水三法（开鬼门、洁净腑、去宛陈挫）以及《金匮要略水气篇》中“腰以上肿当发汗，腰以下肿当利小便”的理论，采用桂枝汤合五苓散加当归，三法合用，1剂后肿即消，后以此法此方治疗 5例头肿案，均 2剂而愈。此案体现了根据经典理论和疾病症状进行辨证论治，有是证用是方。

-高热案：患者发热、头痛、无汗、烦躁、口干、舌淡红苔白、脉浮紧，辨证为太阳病伤寒证兼阳明病，符合《伤寒论》第 39条大青龙汤的适应症，投用大青龙汤原方，1剂而愈。强调依据症状反应准确辨证，果断用药。

-哮喘案：患者素有慢性支气管炎病史，急性发作后，经西医治疗无效。中医诊见咳喘、吐黄白夹杂稠痰、不易咳出、口干苦、头晕、大便三日未解、晚上咳喘加重、舌淡苔白略黄、脉沉弦细。辨证为少阳、阳明合病挟瘀，予大柴胡汤合桂枝茯苓丸，因体虚加党参，因咳喘加厚朴、杏仁，3剂后症状全部消失。此例展示了综合分析症状，辨别病位、病性，精准辨证，方证对应的重要性。

-心悸案：案例一，患者头晕、口干苦、便干、四逆、下肢浮肿、嗜卧、纳差、舌淡苔白、脉沉弦细，辨证为厥阴病上热下寒证合并血虚水盛，用柴胡桂枝干姜汤合当归芍药散，1剂后能起床活动，纳差诸症减，原方再进三剂，诸症消失。案例二，患者有心房纤颤病史，摔倒后头晕、心悸、口中和、四逆、纳差、便溏、舌淡苔白、边有齿痕、脉沉弦微细，辨证为太阴病，气血阴阳俱不足，方用四逆汤合生脉饮加生龙牡，3剂后头晕、心悸止，随访至今无复发。这两个心悸案例体现了对复杂病症的精细辨证，以及根据辨证结果准确选方用药以达到良好疗效。

-中风先兆案：患者有脑梗塞病史，自觉舌头发硬、说话不清晰、口干苦、舌下静脉旁有瘀斑、舌淡苔白、脉沉弦细。辨证为少阴阳明合病，大柴胡汤方证，且内有瘀血，桂枝茯苓丸方证。用柴胡、黄芩、半夏、大黄等药治疗，3剂后一切症状消失。此例说明依据症状准确判断病位和病性，同时注重心理治疗，体现了中医辨证论治的全面性和灵活性，以及经方不仅能治疗急慢性疾病，还具有截断治疗作用。

-带下案：患者半年来白带特多，质清稀如水，口中和，舌淡苔白，脉沉弦。根据《伤寒论》条文精神及胡老学说，辨为少阴病，用桂枝加附子汤治疗，3剂后白带明显减少，服三剂尽，白带变为正常。此案例强调认真领会《伤寒论》条文精神实质，灵活运用于临床，以扩大经方使用范围。

在《中医俱乐部举办中医基础知识讲座第四期——六经辨证的实质是六证》中，石应轩详细讲解了胡派伤寒论的六经辨证。他指出六经的实质是六证，即利用表、里、半表半里三个病位与阴阳两种属性排列组合而成，具体为表阳（太阳病）、表阴（少阴病）、里阳（阳明病）、里阴（太阴病）、半表半里阳（少阳病）、半表半里阴（厥阴病），且每个病位的证有其对应的症状表现和治疗方法。例如太阳病“脉浮，头项强痛而恶寒”，中风用桂枝汤方证，伤寒用麻黄汤方证；少阴病“脉微细，但欲寐也”，在桂枝汤和麻黄汤方证基础上加附子；阳明病根据病位不同采用吐、清、下法；太阴病用四逆辈治疗；少阳病用小柴胡汤，厥阴病用乌梅丸等。同时强调阴证与阳证、寒证与热证、虚证与实证之间可互相转化，使用方证时需结合患者体质和实际情况具体分析，还可使用“三印诊断法”判断患者体质是否为寒性，以及注意方证的合并与比例问题，以最大限度发挥方证效用。