其实，实验室内的大蛇丸一直是在等着三代火影的到来。时常接触木叶高层的他，实在是太清楚当前的事情是怎么回事了，更何况，旗木朔茂的先例刚刚才发生，虽然他也很厌恶这样的事情，毕竟有种物伤其类，兔死狐悲之感，但是他怎么也没想到，这种事情居然那么快就落到了自己的头上。

在漫长的等待中，大蛇丸的内心也在经历着激烈的思想斗争，面前的那具实验素材，他也只是随意的解刨了几下而已，直到实验室的大门被打开，在看到三代火影的身影的时候，大蛇丸彻底死心了。

大蛇丸转过身，注视着三代火影，三代火影也注视着大蛇丸。三代火影沉声说道：

“大蛇丸，你太让我失望了。”

大蛇丸听到三代火影这样说，一说蛇瞳微缩，突然阴森森的笑了起来，笑的非常开心，也笑的非常凄凉，笑声过后，大蛇丸微笑着，用沙哑的声音对三代火影说道：

“猿飞老师，你老了。”

这句话包含着大蛇丸对三代火影的嘲讽与无奈的心情，其中还夹杂有一丝怜悯之情，说完这句话后，大蛇丸直接夺门而出，离开了木叶村，而三代火影也没有阻拦，他似乎听明白了大蛇丸最后那句话的意思，其实三代火影也是心中怀有着愧疚之情，整件事情的来龙去脉，三代火影都清楚，虽然这样，但是他却没有阻止，年老的三代火影，不单是实力开始跌落，而且他也已经失去了年轻时韧性，对于现在的三代火影来说，和平安稳才是他现在的追求，不愿再争斗的三代火影向其他木叶高层妥协，放弃了大蛇丸。

但是历史的发展却给三代火影开了个玩笑，就在大蛇丸离开木叶村后不久，沙隐村向木叶村宣战，紧接着各国相互宣战，第三次忍界大战爆发了。

坐在火影办公室内的三代火影，猛烈的吸着夹在手中的烟杆，好似要将他现在心中的烦闷以及怒气都发泄到手中的烟上，整个房间内吞云吐雾，坐在房间内沙发上，等待三代火影安排任务的纲手，起身打开了房间内的窗户，让烟雾向外飘散去，然后又坐回了原来的位置，自从被三代火影召集来后，她一直保持着沉默，不发一言。

大蛇丸叛逃这件事情对纲手的触动非常大，她本身是大家族出身，对政治的认识远不是平民忍者可比，尤其是在经历过弟弟和恋人的死亡后，更是有了刻骨铭心恶认识，可以说，三忍之中，纲手的政治觉悟可以说是最高的，对于大蛇丸的事情也有自己的猜测和见解，所以，她才一直保持沉默，若不是现在战争再次爆发，说不定她也离开木叶村了，相比之下，坐在他旁边，一身绷带的自来也，还在叫喧着要找回大蛇丸。

在得知大蛇丸叛逃的消息后，自来也自告奋勇去追赶大蛇丸，希望将大蛇丸带回来，毫无意外的是，他失败了，而且被大蛇丸重伤，被其他人救回了木叶村。自回到木叶村后，他就一直坚持要再去将大蛇丸找回来，直到战争再次爆发，这才最终作罢。