主角觉云，原是蓝星末法修道人，魂穿到世界，面对即将到来的「灭族」之夜。觉云凭借古书修炼神通，以一己之力改变「灭族」的结局…「六道仙人」察觉到觉云这个异类，激发出潜藏在忍者身上的「印记」布下惊天杀局，只为除掉觉云！忍界的一切随着觉云的到来发生了变化，逐渐偏离了六道的「剧本」鼬：觉云，你为什么要阻止我继承“火之意志”？长门：觉云，我会让你多抗几楼米。鸣佐：我们要谨记六道仙人的嘱托，将他封印！宇智波班