在彻底捣毁海边的秘密实验室后，艾米丽、杰克和托马斯继续致力于确保世界不再受复制吞噬者的威胁。然而，世界的某个角落，黑暗的计划正在悄然重生。

在遥远的沙漠深处，有一座被风沙掩盖的古老遗迹。一个名为黑暗教团的神秘组织，他们一直在寻找能统治世界的强大力量，偶然发现了艾克公司关于复制吞噬者研究的残片。教团内的大祭司阿德尔，一个眼神中充满狂热欲望的人，认为这就是他们苦苦寻觅的终极力量。

阿德尔带领着教团中的顶尖术士和工匠，在遗迹中建立起一座简陋却功能齐全的实验室。他们依据那稀少的资料，试图重现复制吞噬者。

与此同时，艾米丽他们在调查中发现了一些关于黑暗教团异常活动的线索。一些黑市文物交易似乎都与这个组织有关，而且有传闻说沙漠中出现了一些超自然的蓝光现象。

艾米丽、杰克和托马斯乘坐直升机前往那片沙漠。当他们靠近遗迹时，直升机的电子系统突然受到干扰，他们不得不紧急迫降在附近的沙丘上。

“看来我们离目标已经不远了。”托马斯看着失灵的设备说道。

他们徒步走向遗迹，沙漠的烈日炙烤着他们，沙粒在风中呼啸。当他们接近遗迹入口时，一股熟悉的蓝色光芒从里面透出，同时伴随着一阵低沉的嗡嗡声。

走进遗迹内部，他们看到了令人震惊的一幕。黑暗教团已经成功创造出了一个新的复制吞噬者，不过这个复制吞噬者的外观与之前不同，它的身体像是由无数古老的符文和黑色晶体组成，散发着更加邪恶的气息。

阿德尔看到他们的到来，露出了狰狞的笑容，“你们这些碍事的家伙，今天就是你们的死期。这个复制吞噬者将为教团扫除一切障碍，然后我们将统治世界。”

复制吞噬者在阿德尔的命令下，朝着艾米丽他们扑来。它所到之处，地面的石块和石柱都被迅速吞噬分解。