在与伊布四兄弟依依惜别之后，小智、子麟一行人继续踏上了旅程，不料在途中遭遇了贪吃的卡比兽挡道，随后他们又巧妙地解决了卡兹道馆与亚斯道馆之间的纷争，在之后又奇遇超古代宝可梦，以及一个极为可怕的胖丁。就这样，一行人带着种种经历，来到了风光旖旎的大傻谷。
数日之后，小智、子麟等人抵达了大傻谷——这个因壮丽的大溪谷景色而闻名遐迩的地方。然而，映入眼帘的并非想象中的绝美风光，而是满目的石堆。正当众人疑惑之际，只见浩浩荡荡的人群，少说也有百余人，皆身着登山装，背负登山包，头戴安全帽，手持镐子，成群结队地涌入大傻谷。
“这些人究竟在做什么？”小霞好奇地问道。
“大傻谷，究竟发生了什么事情？”小智也满心疑惑。
就在这时，身后突然传来一个熟悉的声音：“不会吧，你连这种大事都不知道？”众人转身一看，只见全副武装的小茂不知何时已站在了他们身后。
“啊哈哈哈，好久不见，小智、子麟，还有大家。”小茂热情地打招呼。
“你为什么打扮成这样？”小智不解地问。
“因为这里发现了已经绝种的神奇宝贝化石，所以大家都兴奋地前来寻找。”小茂解释道。
“神奇宝贝化石？”小智更加好奇了。
然而，小智的话还未说完，就听到远处传来阵阵加油声：“小茂加油，小茂加油，小茂小茂一级棒！”小茂高兴地回应着，并向那些为他加油的“女朋友们”挥手致意。这一幕，直接让在场的众人震惊不已，尤其是子麟，心中暗想：小茂还是那么不成熟啊。
“不行，再聊下去，重要的化石就要被别人挖走了。”小茂急切地说，“所以，我现在很忙，没时间和吊车尾闲聊了。对了，子麟，你也赶紧去挖化石吧。”
“什么？你说谁是吊车尾？”小智一听，顿时火冒三丈，幸好小霞和小刚及时拉住了他。
“既然这样，我要比小茂那家伙更快找到神奇宝贝化石，让他知道我的厉害！”小智愤愤不平地说。
“可是我觉得这么做，就是故意去吵醒那些变成化石、沉睡在地底的古代神奇宝贝呀。”小刚提出异议。
“可是寻找数万年前就灭绝的神奇宝贝化石，不是很浪漫吗？”小霞反驳道。
“是啊，是啊，我们也很想看看关东的化石神奇宝贝呢。”巴贝娜和荷莲娜附和道。
“那……那个，我……我也……”小春也弱弱地表达了自己的意愿。
经过一番商量，最终少数服从多数，小刚妥协了。不过，他还是问了子麟一句：“子麟，你怎么看？”
闻言，众人的目光再次聚焦在子麟身上。现在在队伍中，子麟的决定通常都很有权威性和关键性。面对大家的目光，子麟平静地说：“去看看吧，如果出了什么问题，我和小智会保护好大家的，不是吗？”
小智也坚定地表示：“没错，子麟说得对，我们会保护好大家的。”
“哦耶，太棒了”x4四位女孩子闻言，脸上绽放出灿烂的笑容，欢呼声此起彼伏。
见此情景，小刚也只能无奈地摇了摇头，默许了大家的决定。
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“真是的，就这么点工具竟然要我们花这么多钱，这商家也太黑了吧！”子麟刚走出店铺就忍不住抱怨起来。
小刚无奈地摇了摇头：“唉，这也是没办法的事。最近大傻谷挖化石的人这么多，商家看到商机，涨价也是情理之中的。”
就在这时，小智却已经迫不及待地急匆匆地跑了出去：“哎呀，你们两个别聊了，小茂都快把化石挖光了，我先走一步了！”
“小智，你别这么着急啊！”小霞和小刚连忙追了上去。
巴贝娜和荷莲娜看着子麟，有些不知所措：“那我们接下来该怎么办，子麟……大人？”小春则目不转睛地盯着子麟，似乎在等待他的指示。
子麟无奈地笑了笑：“我不是说过很多次了吗？不要这么叫我，直接叫我子麟就好了。”
巴贝娜和荷莲娜调皮地扮了个鬼脸，舌头轻轻吐出：“哈哈哈，这样称呼多有趣呢。我就这么叫了，子麟大人？子麟大人？子麟大人……”她们边说边笑，嬉闹着跟了上去。
子麟无奈地摇了摇头，带着小春也跟了上去。他心里暗想：或许，在这个世界上，也只有巴贝娜和荷莲娜敢这样和我开玩笑了吧。不过，这样的氛围还真不错。
另一边，小茂加入了化石挖掘的行列，很快就有了收获。他兴奋地捡起一块化石，高声宣布：“成功了，我得到宝可梦的化石了！”
“耶，小茂加油，小茂加油，小茂小茂最棒，耶！”几个女粉丝为他呐喊助威。
恰好此时，子麟一行人经过，小茂迫不及待地向他们炫耀：“子麟，你看，我得到神奇宝贝的化石了！怎么样，厉害吧？”然而，他还没等子麟一行人开口，又继续说道：“哈哈哈，你别羡慕，我马上找人研究一下，看看是谁的化石，再来告诉你。”
很快，一位考古专家从小茂手中接过化石，用放大镜仔细研究。
“怎么样啊？我第一次挖就挖到了！对了，你知道这是哪种宝可梦的化石吗？我和我的朋友们都等着呢！”小茂一脸得意。
“这个是……这个是宝可梦粪便的化石。”专家的话让小茂差点晕倒。
“讨厌，大便啊！”几个女粉丝失望地喊道。
巴贝娜、荷莲娜和小春听到后，忍不住捧腹大笑：“哈哈哈，他还在我们面前炫耀呢，原来挖到的是大便啊！”
小茂的脸瞬间涨得通红，不甘示弱地喊道：“别小看我！我很快就会挖到真正的化石的！”
正当子麟想充当和事佬，调解双方的矛盾时，远方突然传来一声巨响“砰——”，紧接着地表开始剧烈震动。几人心中一惊：难道是地震？
还没来得及多想，他们就因为地表塌陷而掉了下去。